Задваивается сумма налога в уточненной декларации по НДС

Добрый день!
Сдаю уточненку по НДС. В налоговой декларация поступает неверно. В книге покупок, где были изменения, значения сумма налога удваивается, соответственно в налоговой выходит расхождения с моими контрагентами. При этом, книга покупок, распечатанная из этой же декларации, полностью соответствует. Инспекторы сами видят что в бумажном виде все норм, а электронном в их программе выходят расхождения. Мне посоветовали проверить признак актуальности, но и там все верно. Пробовал менять программу отправки отчетности, тоже не помогло. Может кто сталкивался с подобной проблемой. Буду очень признателен. Спасибо!